Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms