Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms