Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACANP16112 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACANP16112 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACANP16112 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACANP16112 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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