Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMP4P12644 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMP4P12644 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms