Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms