Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms