Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2P0DI81 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms