Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTXN2P0C2S0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms