Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms