Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms