Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT6BP04259 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT6BP04259 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms