Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POP4O95707 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POP4O95707 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms