Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKAP2O75563 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms