Protein–RNA interactions for Protein: O75417

POLQ, DNA polymerase theta, humanhuman

Predictions only

Length 2,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLQO75417 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLQO75417 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLQO75417 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLQO75417 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLQO75417 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLQO75417 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLQO75417 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms