Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA4O75335 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms