Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA3O75145 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms