Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG13O75143 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG13O75143 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG13O75143 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG13O75143 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms