Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms