Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms