Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms