Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms