Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A2O14975 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms