Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD1B0YJ81 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms