Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIPT2A6NK58 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms