Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF22A3QJZ6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms