Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0B4J2E0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms