Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX11Q9Y5W9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX11Q9Y5W9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms