Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms