Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK1Q9UPV9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK1Q9UPV9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms