Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNIKQ9UKE5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms