Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBE1Q9UJT0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBE1Q9UJT0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms