Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SALL4Q9UJQ4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL4Q9UJQ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms