Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms