Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms