Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS7AQ9UBW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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