Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC17A6Q9P2U8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms