Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms