Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms