Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJC28Q9NX36 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms