Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM106BQ9NUM4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms