Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG3Q9NT62 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms