Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms