Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA4BQ9NPR2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms