Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RAB9BQ9NP90 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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