Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC52A2Q9HAB3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms