Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms