Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNPKQ9C0E8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms