Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms