Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECSITQ9BQ95 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECSITQ9BQ95 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms