Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX2Q99697 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms